Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGN3Q15651 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGN3Q15651 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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