Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIV2LQ15477 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIV2LQ15477 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms