Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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