Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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