Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IRF4Q15306 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF4Q15306 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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