Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCOLCEQ15113 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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