Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD3Q15059 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD3Q15059 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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