Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX17Q15036 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX17Q15036 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX17Q15036 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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