Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERPUD1Q15011 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERPUD1Q15011 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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