Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD4Q14839 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD4Q14839 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms