Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP1BQ14684 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP1BQ14684 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP1BQ14684 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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