Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEDD9Q14511 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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