Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2H2Q13888 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2H2Q13888 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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