Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR3Q13615 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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