Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PKD2Q13563 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKD2Q13563 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
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