Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDAC1Q13547 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC1Q13547 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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