Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATRQ13535 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATRQ13535 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATRQ13535 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRQ13535 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRQ13535 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRQ13535 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRQ13535 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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