Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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