Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRSF6Q13247 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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