Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME3Q13232 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME3Q13232 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME3Q13232 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME3Q13232 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME3Q13232 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME3Q13232 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME3Q13232 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME3Q13232 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME3Q13232 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME3Q13232 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME3Q13232 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME3Q13232 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME3Q13232 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME3Q13232 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME3Q13232 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME3Q13232 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME3Q13232 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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