Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXF1Q12946 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF1Q12946 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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