Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDH17Q12864 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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