Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TROQ12816 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TROQ12816 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TROQ12816 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TROQ12816 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TROQ12816 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TROQ12816 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TROQ12816 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TROQ12816 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TROQ12816 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TROQ12816 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TROQ12816 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TROQ12816 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TROQ12816 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TROQ12816 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TROQ12816 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TROQ12816 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TROQ12816 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TROQ12816 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TROQ12816 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TROQ12816 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TROQ12816 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TROQ12816 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TROQ12816 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TROQ12816 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
TROQ12816 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TROQ12816 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TROQ12816 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TROQ12816 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TROQ12816 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TROQ12816 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TROQ12816 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TROQ12816 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TROQ12816 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TROQ12816 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TROQ12816 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TROQ12816 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TROQ12816 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TROQ12816 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TROQ12816 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TROQ12816 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TROQ12816 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TROQ12816 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TROQ12816 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
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