Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YMR1YJR110W 2067 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 TRX3YCR083W 384 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 YCR085WYCR085W 354 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 YDR133CYDR133C 336 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 SGN1YIR001C 753 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 YJL028WYJL028W 336 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 YLR225CYLR225C 1224 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 SSO2YMR183C 888 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 YSA1YBR111C 696 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 MRPS9YBR146W 837 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 YBR238CYBR238C 2196 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 CAF130YGR134W 3369 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 OSH3YHR073W 2991 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB17Q12342 GRX6YDL010W 696 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 ATP12YJL180C 978 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 REH1YLR387C 1299 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 VPS28YPL065W 729 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 UBX5YDR330W 1503 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 MSD1YPL104W 1977 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YGL152CYGL152C 678 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 TMC1YOR052C 453 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 FDH1YOR388C 1131 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 RRN7YJL025W 1545 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YPK3YBR028C 1578 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 OTU1YFL044C 906 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YHL045WYHL045W 348 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 MNT4YNR059W 1743 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 DHR2YKL078W 2208 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 RRN6YBL014C 2685 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 TDA3YHR009C 1572 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 ALG1YBR110W 1350 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 TAF1YGR274C 3201 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 AAD3YCR107W 1092 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YDL071CYDL071C 375 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 TRP4YDR354W 1143 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 ERV29YGR284C 933 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YAL004WYAL004W 648 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 SFH5YJL145W 885 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 HMX1YLR205C 954 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 BLS1YLR408C 369 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 AIM39YOL053W 1188 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 ECM8YBR076W 1065 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 ASI1YMR119W 1875 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 SLM2YNL047C 1971 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 MYO3YKL129C 3819 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 POL31YJR006W 1464 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 ARO9YHR137W 1542 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YLR177WYLR177W 1887 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 MRPL11YDL202W 750 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 REE1YJL217W 597 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YMR084WYMR084W 789 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YPL088WYPL088W 1029 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 PMS1YNL082W 2622 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 RAD7YJR052W 1698 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 EPO1YMR124W 2832 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 XRS2YDR369C 2565 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 FOL2YGR267C 732 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 OMA1YKR087C 1038 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 HRT1YOL133W 366 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 RIB4YOL143C 510 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YBR137WYBR137W 540 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 CPA2YJR109C 3357 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 RTS1YOR014W 2274 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 KRI1YNL308C 1776 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 MRPL6YHR147C 645 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 ARC15YIL062C 465 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YIL089WYIL089W 618 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 IRC25YLR021W 540 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 SCD6YPR129W 1050 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 OAF3YKR064W 2592 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 RNR1YER070W 2667 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB17Q12342 TED1YIL039W 1422 nt3.59□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 CIT1YNR001C 1440 nt3.59□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 REB1YBR049C 2433 nt3.59□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 YVC1YOR087W 2028 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 snR63snR63 255 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SCL1YGL011C 759 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 HRT3YLR097C 1035 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 RIM11YMR139W 1113 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MOH1YBL049W 417 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 ZDS2YML109W 2829 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 ALA1YOR335C 2877 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 STU1YBL034C 4542 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 PWP2YCR057C 2772 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 HAT2YEL056W 1206 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 ERJ5YFR041C 888 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MRH4YGL064C 1686 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 PMT6YGR199W 2280 nt3.57□□□□□ -1.84
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