Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CGNL1Q0VF96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms