Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF543Q08ER8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF543Q08ER8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms