Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSRP1Q08945 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms