Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD300CQ08708 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD300CQ08708 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms