Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LOXL1Q08397 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms