Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LRP1Q07954 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms