Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 PFS1YHR185C 714 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 TMC1YOR052C 453 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YBR116CYBR116C 528 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 COM2YER130C 1332 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 HCM1YCR065W 1695 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 PUT2YHR037W 1728 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 CDC9YDL164C 2268 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 OPT2YPR194C 2634 nt3.83□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YHR202WYHR202W 1809 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YLR152CYLR152C 1731 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 TOS8YGL096W 831 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YGL230CYGL230C 444 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RPL8AYHL033C 771 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 COS8YHL048W 1146 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YHR173CYHR173C 339 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YIL171WYIL171W 330 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 IRC25YLR021W 540 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 EOS1YNL080C 1101 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YNL320WYNL320W 855 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 CIN5YOR028C 888 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 PWR1PWR1 941 nt3.82□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SMP3YOR149C 1551 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YRB30YGL164C 1323 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 AGA1YNR044W 2178 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 COG7YGL005C 840 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RPL24AYGL031C 468 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 VMA7YGR020C 357 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RPL24BYGR148C 468 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 OAR1YKL055C 837 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 ACP1YKL192C 378 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 CSM3YMR048W 954 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SIW14YNL032W 846 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 POP3YNL282W 588 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YOL106WYOL106W 354 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 NOC2YOR206W 2133 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 MED8YBR193C 672 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RTC1YOL138C 4026 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 TAF7YMR227C 1773 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 ECM22YLR228C 2445 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 CTR86YCR054C 1692 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 CET1YPL228W 1650 nt3.81□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 DHR2YKL078W 2208 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 MET12YPL023C 1974 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 ATG2YNL242W 4779 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 APC1YNL172W 5247 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YJR061WYJR061W 2808 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YCL075WYCL075W 441 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RPP1AYDL081C 321 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YDR509WYDR509W 348 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YOS1YER074W-A 258 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SPR6YER115C 576 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YGL117WYGL117W 798 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 MRP4YHL004W 1185 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SUI1YNL244C 327 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 COS1YNL336W 1146 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 TIF5YPR041W 1218 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YPR174CYPR174C 666 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 BCH2YKR027W 2298 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SRO7YPR032W 3102 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 PLM2YDR501W 1566 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 APN2YBL019W 1563 nt3.8□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 ACA1YER045C 1470 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YVC1YOR087W 2028 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 UBP10YNL186W 2379 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SRB7YDR308C 423 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 COX4YGL187C 468 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YHR054CYHR054C 1065 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RPC25YKL144C 639 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SMD2YLR275W 333 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YMR099CYMR099C 894 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SRT1YMR101C 1032 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 ERG29YMR134W 714 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 PFK27YOL136C 1194 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 PEX27YOR193W 1131 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 HUA2YOR284W 732 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 ECM23YPL021W 564 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SAT4YCR008W 1812 nt3.79□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 IDS2YJL146W 1410 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SPT14YPL175W 1359 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 MET17YLR303W 1335 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 PHO87YCR037C 2772 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SNU23YDL098C 585 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YGL204CYGL204C 306 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 SPO11YHL022C 1197 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 GVP36YIL041W 981 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YLR407WYLR407W 687 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 URA5YML106W 681 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 RRN9YMR270C 1098 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YNL035CYNL035C 1170 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 DUG3YNL191W 1074 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 MRPL17YNL252C 846 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 YOR263CYOR263C 408 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 IDI1YPL117C 867 nt3.78□□□□□ -1.8
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