Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP4Q07065 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms