Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms