Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 IME4YGL192W 1803 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 MNR2YKL064W 2910 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 TRM13YOL125W 1431 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 AAD3YCR107W 1092 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 CWC2YDL209C 1020 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 FOL2YGR267C 732 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YKR075CYKR075C 924 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 RIB4YOL143C 510 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 CMR3YPR013C 954 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YPR077CYPR077C 372 nt3.05□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 CIN8YEL061C 3003 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 SLM2YNL047C 1971 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YDR391CYDR391C 699 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 SCM4YGR049W 564 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 RPS0AYGR214W 759 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 BET1YIL004C 429 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 DAN1YJR150C 897 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 RNA1YMR235C 1224 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ATG8YBL078C 354 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 CHS2YBR038W 2892 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 TCP1YDR212W 1680 nt3.04□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 TFB2YPL122C 1542 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 SNQ2YDR011W 4506 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 ALE1YOR175C 1860 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 DRS2YAL026C 4068 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YHR080CYHR080C 4038 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 MAL12YGR292W 1755 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 MAL32YBR299W 1755 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 YRB30YGL164C 1323 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 DOS2YDR068W 933 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 RPS18AYDR450W 441 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 IST1YNL265C 897 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 VPS33YLR396C 2076 nt3.03□□□□□ -1.92
NEJ1Q06148 BUD4YJR092W 4344 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 IOC4YMR044W 1428 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 HER2YMR293C 1395 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 MUP3YHL036W 1641 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 DNM1YLL001W 2274 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 ALG11YNL048W 1647 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 CPR1YDR155C 489 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YHB1YGR234W 1200 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YGR273CYGR273C 525 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 LSM1YJL124C 519 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 PHD1YKL043W 1101 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 SRN2YLR119W 642 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YLR462WYLR462W 609 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 GOT1YMR292W 417 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 CAF130YGR134W 3369 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 RPN1YHR027C 2982 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 FAS1YKL182W 6156 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YMR317WYMR317W 3423 nt3.02□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 SKN7YHR206W 1869 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 GIS4YML006C 2325 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 FKH2YNL068C 2589 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YDL071CYDL071C 375 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YHP1YDR451C 1062 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YIL025CYIL025C 375 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 ECM4YKR076W 1113 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 SAS5YOR213C 747 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YOR238WYOR238W 912 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 VPS53YJL029C 2469 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 GPB1YOR371C 2694 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 SER3YER081W 1410 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 RAD5YLR032W 3510 nt3.01□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 TYR1YBR166C 1359 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 HDA2YDR295C 2025 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 PCI8YIL071C 1335 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 NFI1YOR156C 2181 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YDL242WYDL242W 354 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 LST7YGR057C 729 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 DOG2YHR043C 741 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 DDP1YOR163W 567 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 NAM9YNL137C 1461 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 MIH1YMR036C 1665 nt3□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 RNY1YPL123C 1305 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 RKM3YBR030W 1659 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YIL175WYIL175W 318 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 MRT4YKL009W 711 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 INN1YNL152W 1230 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 IZH2YOL002C 954 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YDL180WYDL180W 1644 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 NPL4YBR170C 1743 nt2.99□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 IOC3YFR013W 2364 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 CPA2YJR109C 3357 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 PEX10YDR265W 1014 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YFL051CYFL051C 483 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 MBR1YKL093W 1020 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 JLP1YLL057C 1239 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 MCM1YMR043W 861 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 YIM2YMR151W 438 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 VPS21YOR089C 633 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 SPO71YDR104C 3738 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 DOA4YDR069C 2781 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 MAK21YDR060W 3078 nt2.98□□□□□ -1.93
NEJ1Q06148 IMH1YLR309C 2736 nt2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms