Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTDSPL2Q05D32 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms