Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms