Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTK2Q05397 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms