Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms