Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	PRS5	YOL061W	1491 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	MNR2	YKL064W	2910 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	MCM7	YBR202W	2538 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	RRP17	YDR412W	708 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	TOS8	YGL096W	831 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	TMA19	YKL056C	504 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	ECM8	YBR076W	1065 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	VPS27	YNR006W	1869 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	VPS73	YGL104C	1461 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	RTS1	YOR014W	2274 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YFL040W	YFL040W	1623 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	SHU2	YDR078C	672 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YGR051C	YGR051C	324 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	TFA2	YKR062W	987 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YML053C	YML053C	639 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	CYC2	YOR037W	1101 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	FSH3	YOR280C	801 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YOR314W	YOR314W	330 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	RAD2	YGR258C	3096 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	PMT6	YGR199W	2280 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	CDC8	YJR057W	651 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	MTR2	YKL186C	555 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	NIT3	YLR351C	876 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	MRPS17	YMR188C	714 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YMR306C-A	YMR306C-A	390 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YNR071C	YNR071C	1029 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	PWR1	PWR1	941 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	FRM2	YCL026C-A	582 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	VPS45	YGL095C	1734 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	PRP3	YDR473C	1410 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SYF1	Q04048	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YER076C	YER076C	909 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	ADH4	YGL256W	1149 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	BIO2	YGR286C	1128 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	REC104	YHR157W	549 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RUF21	RUF21	707 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YOR186W	YOR186W	435 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	PNT1	YOR266W	1272 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	MTC4	YBR255W	2085 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RPO31	YOR116C	4383 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	HIM1	YDR317W	1245 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YIL025C	YIL025C	375 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RSM25	YIL093C	795 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TMC1	YOR052C	453 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	OSW1	YOR255W	837 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RFM1	YOR279C	933 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YOR338W	YOR338W	1092 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TRK1	YJL129C	3708 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	GEM1	YAL048C	1989 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	AKR1	YDR264C	2295 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	PST1	YDR055W	1335 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TRM1	YDR120C	1713 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	CTH1	YDR151C	978 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	DDI2	YFL061W	678 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	MPC1	YGL080W	393 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RPB3	YIL021W	957 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YAL069W	YAL069W	315 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	DDI3	YNL335W	678 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	UAF30	YOR295W	687 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RPO21	YDL140C	5202 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.25	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	HAT2	YEL056W	1206 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YER034W	YER034W	558 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	AIM22	YJL046W	1230 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YMR178W	YMR178W	825 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	MCM16	YPR046W	546 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RNR1	YER070W	2667 nt		4.24	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	CAB2	YIL083C	1098 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	IST1	YNL265C	897 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	IRC14	YOR135C	342 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	PIM1	YBL022C	3402 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	CLG1	YGL215W	1359 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	GCD1	YOR260W	1737 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TRE2	YOR256C	2430 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	ULS1	YOR191W	4860 nt		4.23	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	ATG2	YNL242W	4779 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YKR015C	YKR015C	1707 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YDL186W	YDL186W	834 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YOS1	YER074W-A	258 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	LAC1	YKL008C	1257 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	MAP1	YLR244C	1164 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TEX1	YNL253W	1269 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	RFC3	YNL290W	1023 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YBL096C	YBL096C	309 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	YCL001W-A	YCL001W-A	462 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	HAP4	YKL109W	1665 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.22	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	TAF8	YML114C	1533 nt		4.21	□□□□□ -1.73
SYF1	Q04048	AIM6	YDL237W	1173 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	RRP8	YDR083W	1179 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	KEG1	YFR042W	603 nt		4.21	□□□□□ -1.74
SYF1	Q04048	YGR017W	YGR017W	894 nt		4.21	□□□□□ -1.74

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