Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 HEF3YNL014W 3135 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 TRX3YCR083W 384 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 TCA17YEL048C 459 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 POP6YGR030C 477 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 EBP2YKL172W 1284 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 CPR3YML078W 549 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 INA17YPL099C 549 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 VPS53YJL029C 2469 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 KAR5YMR065W 1515 nt3.49□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 MYO3YKL129C 3819 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 CDC9YDL164C 2268 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YCR050CYCR050C 309 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 TRP4YDR354W 1143 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 SPT4YGR063C 309 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YAE1YJR067C 426 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 ARC19YKL013C 516 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 JLP1YLL057C 1239 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 MRPS8YMR158W 468 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 RIB4YOL143C 510 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YBR089WYBR089W 600 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YJR030CYJR030C 2238 nt3.48□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 CMK1YFR014C 1341 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 MSD1YPL104W 1977 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 ALR2YFL050C 2577 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 MRPL32YCR003W 552 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YDL157CYDL157C 357 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 FMP32YFL046W 624 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YGL074CYGL074C 327 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 SDT1YGL224C 843 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YMR178WYMR178W 825 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 CTL1YMR180C 963 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 YIP3YNL044W 531 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 RRP36YOR287C 903 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 DER1YBR201W 636 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 SOF1YLL011W 1470 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 RRN6YBL014C 2685 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 GPB1YOR371C 2694 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 SRS2YJL092W 3525 nt3.47□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 HFD1YMR110C 1599 nt3.46□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 MTH1YDR277C 1302 nt3.46□□□□□ -1.85
VHS1Q03785 BUD27YFL023W 2391 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 FAD1YDL045C 921 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YHL026CYHL026C 948 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 DIA1YMR316W 1011 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 ATG19YOL082W 1248 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 SHE3YBR130C 1278 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YLR352WYLR352W 2424 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YER077CYER077C 2067 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 TYR1YBR166C 1359 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 RAD2YGR258C 3096 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 VPS30YPL120W 1674 nt3.46□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 PRP22YER013W 3438 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 URA2YJL130C 6645 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 REB1YBR049C 2433 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 DAN4YJR151C 3486 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 ALG11YNL048W 1647 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 MRPL11YDL202W 750 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YDR124WYDR124W 975 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YDR391CYDR391C 699 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YGR168CYGR168C 1131 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YGR219WYGR219W 342 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 FOL2YGR267C 732 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 OSH3YHR073W 2991 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 SOD1YJR104C 465 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 OAR1YKL055C 837 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 MED7YOL135C 669 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YOL166CYOL166C 339 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 VPS21YOR089C 633 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YBR053CYBR053C 1077 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 CNS1YBR155W 1158 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 APP1YNL094W 1764 nt3.45□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 PTR3YFR029W 2037 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 TAF6YGL112C 1551 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 PHO13YDL236W 939 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 RPA14YDR156W 414 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 FMP10YER182W 735 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YFR045WYFR045W 930 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 DID4YKL002W 699 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 ERV41YML067C 1059 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 BOI2YER114C 3123 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 MDM38YOL027C 1722 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 BCH2YKR027W 2298 nt3.44□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 ARI1YGL157W 1044 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 ECM34YHL043W 513 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 ANB1YJR047C 474 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 YAR070CYAR070C 300 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 NIT3YLR351C 876 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 SEC65YML105C 822 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 WRS1YOL097C 1299 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 SPS4YOR313C 1017 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 snR37snR37 386 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 STV1YMR054W 2673 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 IOC4YMR044W 1428 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 CIT1YNR001C 1440 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 SYF1YDR416W 2580 nt3.43□□□□□ -1.86
VHS1Q03785 HMS1YOR032C 1305 nt3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.3 ms