Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNC4Q03721 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNC4Q03721 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms