Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAP1Q03518 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms