Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNB1Q02641 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms