Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OC90Q02509 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OC90Q02509 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OC90Q02509 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OC90Q02509 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OC90Q02509 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OC90Q02509 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OC90Q02509 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OC90Q02509 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OC90Q02509 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OC90Q02509 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms