Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP4Q02446 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP4Q02446 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SP4Q02446 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SP4Q02446 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP4Q02446 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP4Q02446 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP4Q02446 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP4Q02446 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP4Q02446 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP4Q02446 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms