Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP27A1Q02318 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms