Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHDQ02161 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHDQ02161 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHDQ02161 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHDQ02161 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHDQ02161 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHDQ02161 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHDQ02161 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHDQ02161 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHDQ02161 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHDQ02161 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHDQ02161 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHDQ02161 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms