Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDR2Q01850 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDR2Q01850 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDR2Q01850 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms