Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SATB1Q01826 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms