Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF2Q01130 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms